Филиппинские острова славятся своими подводными красотами: несколько сотен видов кораллов, разнообразные тропические рыбы, а также крупные морские обитатели — черепахи, дельфины, киты, тигровая и китовая акулы и др. В прибрежной полосе встречаются моллюски-жемчужницы (название говорит само за себя). Общая площадь прибрежных коралловых рифов составляет около 27 тыс. км2. Помимо всего на Филиппинах находится множество рэков времен Второй мировой войны.